واجه جنوب السودان العديد من التحديات الأمنية الداخلية منذ استقلاله في يوليو 2011، لكن أحد أكثر التهديدات خطورة وتعقيدا هو ذلك المرتبط بصراع النخب السياسية، في بلد يبدو فيه التكوين القبلي حاكما للعلاقات البينية في المجتمع. وإلى جانب هذا النوع من الصراع النخبوي، هناك أنواع أخرى من الصراع المسلح في جنوب السودان، مرتبطة بالصراع على الأراضي والماشية اللتين هما مصدرا الثروة والنفوذ الأساسيان في جنوب السودان.